بالرغم من الفوائد الصحية للثوم كمضاد حيوي طبيعي إلا أن هناك أضرار خطيرة عند الإفراط في تناوله .

ويؤكد الباحثون بمجال التغذية أن الإكثار من تناول الثوم يسبب الأضرار التالية :

1- يؤثر على من يعاني من أمراض العيون ويسبب ضبابية الرؤية .

2- يسبب طنين الأذن .

3- جفاف الفم .

4- ضعف الذاكرة وفقدانها .

5- الشعور بثقل الرأس .

ومع ذلك فإن تناول الثوم بإعتدال يساعد على تخفيض سكر الدم والوقاية من الإلتهابات والبكتيريا والفيروسات .